Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CACNA1SQ13698 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CACNA1SQ13698 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNA1SQ13698 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms