Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB3Q13509 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB3Q13509 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB3Q13509 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms