Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSAMPQ13449 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSAMPQ13449 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSAMPQ13449 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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