Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
PDE3BQ13370 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PDE3BQ13370 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDE3BQ13370 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE3BQ13370 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms