Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTGDRQ13258 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PTGDRQ13258 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGDRQ13258 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGDRQ13258 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
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