Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF6Q13247 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF6Q13247 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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