Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1H3Q13133 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1H3Q13133 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR1H3Q13133 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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