Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPS1Q13098 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPS1Q13098 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPS1Q13098 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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