Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX4Q12846 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX4Q12846 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX4Q12846 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX4Q12846 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX4Q12846 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX4Q12846 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
STX4Q12846 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
STX4Q12846 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STX4Q12846 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
STX4Q12846 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
STX4Q12846 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
STX4Q12846 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX4Q12846 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX4Q12846 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX4Q12846 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX4Q12846 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX4Q12846 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STX4Q12846 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STX4Q12846 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STX4Q12846 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX4Q12846 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX4Q12846 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX4Q12846 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX4Q12846 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX4Q12846 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX4Q12846 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX4Q12846 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX4Q12846 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX4Q12846 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX4Q12846 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX4Q12846 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
STX4Q12846 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX4Q12846 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX4Q12846 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX4Q12846 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX4Q12846 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX4Q12846 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX4Q12846 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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