Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNH2Q12809 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNH2Q12809 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNH2Q12809 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNH2Q12809 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH2Q12809 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNH2Q12809 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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