Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 DAL82YNL314W 768 nt4.68□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 HOT1YMR172W 2160 nt4.68□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 TUB3YML124C 1338 nt4.68□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 CIT3YPR001W 1461 nt4.68□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 DED81YHR019C 1665 nt4.67□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 HPC2YBR215W 1878 nt4.67□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 QRI1YDL103C 1434 nt4.67□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 YFL064CYFL064C 525 nt4.67□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 PGU1YJR153W 1086 nt4.67□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 GPM3YOL056W 912 nt4.67□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 YPR202WYPR202W 717 nt4.67□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 snR19snR19 568 nt4.67□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 EMP46YLR080W 1335 nt4.67□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 TFB3YDR460W 966 nt4.66□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 RRP46YGR095C 672 nt4.66□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 YPR195CYPR195C 330 nt4.66□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 SPC97YHR172W 2472 nt4.66□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 SEC18YBR080C 2277 nt4.65□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 ESF1YDR365C 1887 nt4.65□□□□□ -1.66
RTR2Q12378 PRP45YAL032C 1140 nt4.65□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YLR194CYLR194C 765 nt4.65□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 PIN2YOR104W 849 nt4.65□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 CAR1YPL111W 1002 nt4.65□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 GAL4YPL248C 2646 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 BRE2YLR015W 1518 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 FMP33YJL161W 543 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 MIM2YLR099W-A 264 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 TFS1YLR178C 660 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YPL113CYPL113C 1191 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 MDR1YGR100W 2853 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 MSH1YHR120W 2880 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 RTT106YNL206C 1368 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 GDE1YPL110C 3672 nt4.64□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 TEA1YOR337W 2280 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 ABF1YKL112W 2196 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 KNH1YDL049C 807 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 COX26YDR119W-A 201 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 GAT4YIR013C 366 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YLR118CYLR118C 684 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 UBC4YBR082C 447 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 UBX7YBR273C 1311 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 THI20YOL055C 1656 nt4.63□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 NUP1YOR098C 3231 nt4.62□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YEL045CYEL045C 426 nt4.62□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 MNN11YJL183W 1269 nt4.62□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YCL012CYCL012C 405 nt4.62□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 TRM44YPL030W 1704 nt4.62□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 AIM17YHL021C 1398 nt4.62□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 ROT2YBR229C 2865 nt4.62□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 NDC1YML031W 1968 nt4.62□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 MBP1YDL056W 2502 nt4.62□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 LHP1YDL051W 828 nt4.61□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 SUR2YDR297W 1050 nt4.61□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt4.61□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 NIT2YJL126W 924 nt4.61□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YJR115WYJR115W 510 nt4.61□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 MRPL13YKR006C 795 nt4.61□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 CPR6YLR216C 1116 nt4.61□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YNR048WYNR048W 1182 nt4.61□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 TIM54YJL054W 1437 nt4.61□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 PRP28YDR243C 1767 nt4.6□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 MPH2YDL247W 1830 nt4.6□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 FRE1YLR214W 2061 nt4.6□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 ERD1YDR414C 1089 nt4.6□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 PNP1YLR209C 936 nt4.6□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YCL041CYCL041C 495 nt4.6□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 FZO1YBR179C 2568 nt4.59□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 CAD1YDR423C 1230 nt4.59□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 KAP114YGL241W 3015 nt4.59□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 YGR182CYGR182C 354 nt4.59□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 LDB18YLL049W 540 nt4.59□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 SEC13YLR208W 894 nt4.59□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 PGA3YML125C 939 nt4.59□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 GAS3YMR215W 1575 nt4.59□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 GEP3YOR205C 1671 nt4.59□□□□□ -1.67
RTR2Q12378 HRK1YOR267C 2280 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 PAN1YIR006C 4443 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 HXT7YDR342C 1713 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 HXT6YDR343C 1713 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 YPL260WYPL260W 1656 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 YKL151CYKL151C 1014 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 ERG3YLR056W 1098 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 DOM34YNL001W 1161 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 SAC1YKL212W 1872 nt4.58□□□□□ -1.68
RTR2Q12378 ULA1YPL003W 1389 nt4.57□□□□□ -1.68
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