Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM1Q08AH1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACSM1Q08AH1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACSM1Q08AH1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms