Protein–RNA interactions for Protein: Q08562

ULS1, ATP-dependent helicase ULS1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ULS1Q08562 SUP56tL(CAA)A 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 SUP53tL(CAA)C 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 SUP54tL(CAA)G2 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 DBP8YHR169W 1296 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 RFU1YLR073C 603 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt7.09□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 SPG4YMR107W 348 nt7.08□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 TIP41YPR040W 1071 nt7.08□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 FRT2YAL028W 1587 nt7.08□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 RRP3YHR065C 1506 nt7.07□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 GSY2YLR258W 2118 nt7.07□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 RFC2YJR068W 1062 nt7.06□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 HMS2YJR147W 1077 nt7.06□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 MET31YPL038W 534 nt7.06□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 SDA1YGR245C 2304 nt7.06□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 TNA1YGR260W 1605 nt7.06□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 ATR1YML116W 1629 nt7.06□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 HXT14YNL318C 1623 nt7.06□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 BUD16YEL029C 939 nt7.05□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 YGR153WYGR153W 654 nt7.05□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 CEG1YGL130W 1380 nt7.05□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 RSA4YCR072C 1548 nt7.05□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 FUM1YPL262W 1467 nt7.04□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 ROT2YBR229C 2865 nt7.04□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 UBC8YEL012W 657 nt7.04□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 YKL223WYKL223W 333 nt7.04□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 snR10snR10 245 nt7.04□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 RTC1YOL138C 4026 nt7.03□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 NOP58YOR310C 1536 nt7.03□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 BUD22YMR014W 1560 nt7.03□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 EPS1YIL005W 2106 nt7.03□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 ARB1YER036C 1833 nt7.03□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 BRE2YLR015W 1518 nt7.03□□□□□ -1.28
ULS1Q08562 RTC5YOR118W 1704 nt7.02□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 NMD4YLR363C 657 nt7.02□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 YJR124CYJR124C 1347 nt7.02□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 APC4YDR118W 1959 nt7.02□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 YMR196WYMR196W 3267 nt7.02□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 YGP1YNL160W 1065 nt7.01□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 GSP2YOR185C 663 nt7.01□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 RSC6YCR052W 1452 nt7.01□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 MCM6YGL201C 3054 nt7.01□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 MRPL20YKR085C 588 nt7.01□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 IMA2YOL157C 1770 nt7.01□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 TUB3YML124C 1338 nt7□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 GTO1YGR154C 1071 nt7□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 YMR102CYMR102C 2505 nt6.99□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 YNL181WYNL181W 1224 nt6.99□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 ZPS1YOL154W 750 nt6.99□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 ALD3YMR169C 1521 nt6.99□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 ALD2YMR170C 1521 nt6.99□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 GPA1YHR005C 1419 nt6.99□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 RAD30YDR419W 1899 nt6.98□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 DPB4YDR121W 591 nt6.98□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 PIC2YER053C 903 nt6.98□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt6.98□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 PUS1YPL212C 1635 nt6.97□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 POR1YNL055C 852 nt6.97□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 ABF1YKL112W 2196 nt6.96□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 ATG26YLR189C 3597 nt6.96□□□□□ -1.29
ULS1Q08562 ICY2YPL250C 411 nt6.96□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 SIA1YOR137C 1869 nt6.96□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 SAP4YGL229C 2457 nt6.95□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 TRX2YGR209C 315 nt6.95□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 ALG6YOR002W 1635 nt6.95□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 RMD9YGL107C 1941 nt6.95□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 TRS33YOR115C 807 nt6.94□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 CBK1YNL161W 2271 nt6.94□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 DCD1YHR144C 939 nt6.94□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 DPH6YLR143W 2058 nt6.93□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 CBF5YLR175W 1452 nt6.93□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 CTR3YLR411W 726 nt6.93□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 BIT2YBR270C 1638 nt6.93□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 YPL278CYPL278C 303 nt6.92□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 ASK10YGR097W 3441 nt6.92□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 SUP35YDR172W 2058 nt6.92□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 PDR18YNR070W 4002 nt6.92□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 KRE28YDR532C 1158 nt6.91□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 UBI4YLL039C 1146 nt6.91□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 NKP2YLR315W 462 nt6.91□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 RRP40YOL142W 723 nt6.91□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 RPL19AYBR084C-A 570 nt6.91□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 YGL152CYGL152C 678 nt6.9□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 DSC2YOL073C 969 nt6.9□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 OXP1YKL215C 3861 nt6.9□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 ASA1YPR085C 1332 nt6.9□□□□□ -1.3
ULS1Q08562 GAD1YMR250W 1758 nt6.89□□□□□ -1.31
ULS1Q08562 KAR2YJL034W 2049 nt6.89□□□□□ -1.31
ULS1Q08562 GCN20YFR009W 2259 nt6.89□□□□□ -1.31
ULS1Q08562 SNA2YDR525W-A 240 nt6.89□□□□□ -1.31
ULS1Q08562 YNG1YOR064C 660 nt6.89□□□□□ -1.31
ULS1Q08562 YPR071WYPR071W 636 nt6.89□□□□□ -1.31
ULS1Q08562 YCR061WYCR061W 1896 nt6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms