Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXM1Q08050 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXM1Q08050 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXM1Q08050 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms