Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 SLD2YKL108W 1362 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 PPR1YLR014C 2715 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YDL121CYDL121C 450 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 MTQ2YDR140W 666 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YRA1YDR381W 681 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 MPC1YGL080W 393 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 MFA2YNL145W 117 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 ELP2YGR200C 2367 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 ORC5YNL261W 1440 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 FRE7YOL152W 1863 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 SIP5YMR140W 1470 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 NTH2YBR001C 2343 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YCL065WYCL065W 369 nt4.93□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 SNM1YDR478W 597 nt4.93□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 LSM12YHR121W 564 nt4.93□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 CTR2YHR175W 570 nt4.93□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 UBA3YPR066W 900 nt4.93□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YNL095CYNL095C 1929 nt4.93□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 SSY5YJL156C 2100 nt4.93□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 UTP7YER082C 1665 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 MIF2YKL089W 1650 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 PWP1YLR196W 1731 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 MRF1YGL143C 1242 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 FMP48YGR052W 1110 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 YJL215CYJL215C 360 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 MAC1YMR021C 1254 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 AAD15YOL165C 432 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 FRE3YOR381W 2136 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 OCA5YHL029C 2040 nt4.92□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 MCM21YDR318W 1107 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 EGD2YHR193C 525 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 XPT1YJR133W 630 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 PDR16YNL231C 1056 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 CAM1YPL048W 1248 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 PEX32YBR168W 1242 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 TRK2YKR050W 2670 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 MRK1YDL079C 1506 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 ATE1YGL017W 1512 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 SNT2YGL131C 4212 nt4.91□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 EXO1YOR033C 2109 nt4.9□□□□□ -1.62
SSK1Q07084 UBC6YER100W 753 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YGR011WYGR011W 327 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 MND2YIR025W 1107 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 MTW1YAL034W-A 870 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 ADD37YMR184W 597 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 SNO4YMR322C 714 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 MDY2YOL111C 639 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 HSP33YOR391C 714 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 HSP32YPL280W 714 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 HES1YOR237W 1305 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 CYK3YDL117W 2658 nt4.9□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 LCB2YDR062W 1686 nt4.89□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 VPS36YLR417W 1701 nt4.89□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 CTS2YDR371W 1536 nt4.89□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 IPK1YDR315C 846 nt4.89□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 VMA16YHR026W 642 nt4.89□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YOR289WYOR289W 756 nt4.89□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 RAD17YOR368W 1206 nt4.89□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt4.89□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 DPH2YKL191W 1605 nt4.89□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 BRF1YGR246C 1791 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 HAP1YLR256W 4509 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 MAD3YJL013C 1548 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 TUL1YKL034W 2277 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 snR78snR78 87 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 GCS1YDL226C 1059 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 ASP1YDR321W 1146 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 SYF2YGR129W 648 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 SPC34YKR037C 888 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YOL050CYOL050C 321 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YPL113CYPL113C 1191 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 MRE11YMR224C 2079 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 PUF3YLL013C 2640 nt4.88□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 NGL2YMR285C 1548 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 MET7YOR241W 1647 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 SYG1YIL047C 2709 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 IMA1YGR287C 1770 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 INO2YDR123C 915 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 RMD5YDR255C 1266 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 SSP120YLR250W 705 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 COX11YPL132W 903 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 STE50YCL032W 1041 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 MCX1YBR227C 1563 nt4.87□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 SOG2YOR353C 2376 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 SHE10YGL228W 1734 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 NUP1YOR098C 3231 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 RML2YEL050C 1182 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YGL262WYGL262W 528 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 IPI1YHR085W 1005 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YKL169CYKL169C 384 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 CSL4YNL232W 879 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 DXO1YDR370C 1329 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 DFG5YMR238W 1377 nt4.86□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YDL241WYDL241W 372 nt4.85□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YDR154CYDR154C 351 nt4.85□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 ERV14YGL054C 417 nt4.85□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 YIL086CYIL086C 309 nt4.85□□□□□ -1.63
SSK1Q07084 PGA3YML125C 939 nt4.85□□□□□ -1.63
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