Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CKAP4Q07065 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKAP4Q07065 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKAP4Q07065 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms