Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FMODQ06828 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FMODQ06828 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FMODQ06828 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FMODQ06828 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FMODQ06828 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FMODQ06828 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FMODQ06828 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FMODQ06828 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FMODQ06828 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FMODQ06828 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FMODQ06828 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FMODQ06828 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FMODQ06828 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FMODQ06828 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FMODQ06828 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FMODQ06828 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FMODQ06828 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FMODQ06828 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FMODQ06828 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FMODQ06828 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FMODQ06828 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FMODQ06828 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FMODQ06828 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FMODQ06828 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FMODQ06828 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FMODQ06828 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FMODQ06828 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FMODQ06828 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FMODQ06828 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FMODQ06828 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FMODQ06828 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FMODQ06828 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FMODQ06828 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FMODQ06828 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FMODQ06828 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FMODQ06828 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FMODQ06828 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FMODQ06828 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FMODQ06828 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FMODQ06828 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FMODQ06828 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FMODQ06828 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FMODQ06828 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FMODQ06828 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FMODQ06828 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FMODQ06828 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FMODQ06828 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FMODQ06828 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FMODQ06828 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FMODQ06828 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FMODQ06828 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FMODQ06828 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FMODQ06828 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FMODQ06828 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FMODQ06828 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FMODQ06828 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms