Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN1Q05586 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN1Q05586 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms