Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPN12Q05209 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPN12Q05209 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPN12Q05209 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms