Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKCQQ04759 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCQQ04759 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms