Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLE4Q04727 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLE4Q04727 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLE4Q04727 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLE4Q04727 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLE4Q04727 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TLE4Q04727 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TLE4Q04727 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TLE4Q04727 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms