Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
OCA2Q04671 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OCA2Q04671 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms