Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.18
ATP7AQ04656 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ATP7AQ04656 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
ATP7AQ04656 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ATP7AQ04656 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms