Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFF2Q03403 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFF2Q03403 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFF2Q03403 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms