Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ID3Q02535 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ID3Q02535 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ID3Q02535 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ID3Q02535 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ID3Q02535 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ID3Q02535 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ID3Q02535 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ID3Q02535 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ID3Q02535 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ID3Q02535 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ID3Q02535 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ID3Q02535 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ID3Q02535 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ID3Q02535 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ID3Q02535 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ID3Q02535 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ID3Q02535 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ID3Q02535 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ID3Q02535 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ID3Q02535 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ID3Q02535 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ID3Q02535 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ID3Q02535 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ID3Q02535 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ID3Q02535 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ID3Q02535 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ID3Q02535 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ID3Q02535 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ID3Q02535 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ID3Q02535 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ID3Q02535 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ID3Q02535 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ID3Q02535 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms