Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSC2Q02487 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms