Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIBQ01892 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPIBQ01892 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPIBQ01892 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPIBQ01892 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPIBQ01892 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPIBQ01892 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPIBQ01892 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPIBQ01892 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIBQ01892 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIBQ01892 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIBQ01892 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPIBQ01892 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIBQ01892 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIBQ01892 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIBQ01892 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIBQ01892 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIBQ01892 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIBQ01892 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIBQ01892 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIBQ01892 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIBQ01892 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIBQ01892 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIBQ01892 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIBQ01892 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIBQ01892 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIBQ01892 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIBQ01892 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIBQ01892 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIBQ01892 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIBQ01892 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPIBQ01892 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIBQ01892 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms