Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMP22Q01453 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms