Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC5Q00444 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC5Q00444 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC5Q00444 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC5Q00444 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXC5Q00444 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC5Q00444 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC5Q00444 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC5Q00444 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC5Q00444 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC5Q00444 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC5Q00444 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC5Q00444 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC5Q00444 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC5Q00444 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC5Q00444 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC5Q00444 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC5Q00444 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXC5Q00444 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC5Q00444 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC5Q00444 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXC5Q00444 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC5Q00444 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC5Q00444 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC5Q00444 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXC5Q00444 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXC5Q00444 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC5Q00444 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC5Q00444 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXC5Q00444 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms