Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX3P78415 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX3P78415 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX3P78415 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX3P78415 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX3P78415 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRX3P78415 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX3P78415 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX3P78415 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX3P78415 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX3P78415 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX3P78415 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX3P78415 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX3P78415 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX3P78415 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX3P78415 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX3P78415 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX3P78415 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX3P78415 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX3P78415 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX3P78415 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX3P78415 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX3P78415 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX3P78415 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX3P78415 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX3P78415 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX3P78415 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX3P78415 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX3P78415 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX3P78415 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX3P78415 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX3P78415 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX3P78415 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX3P78415 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX3P78415 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX3P78415 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX3P78415 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX3P78415 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX3P78415 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX3P78415 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX3P78415 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX3P78415 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX3P78415 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX3P78415 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX3P78415 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX3P78415 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX3P78415 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX3P78415 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX3P78415 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX3P78415 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX3P78415 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX3P78415 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX3P78415 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRX3P78415 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX3P78415 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX3P78415 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX3P78415 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX3P78415 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX3P78415 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX3P78415 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX3P78415 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRX3P78415 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX3P78415 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX3P78415 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX3P78415 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX3P78415 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX3P78415 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX3P78415 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX3P78415 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX3P78415 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IRX3P78415 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IRX3P78415 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX3P78415 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX3P78415 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX3P78415 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX3P78415 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX3P78415 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX3P78415 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX3P78415 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX3P78415 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IRX3P78415 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms