Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX6P78412 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX6P78412 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX6P78412 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX6P78412 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX6P78412 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX6P78412 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
IRX6P78412 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX6P78412 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX6P78412 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX6P78412 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX6P78412 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX6P78412 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX6P78412 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX6P78412 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX6P78412 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX6P78412 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX6P78412 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX6P78412 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX6P78412 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX6P78412 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX6P78412 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX6P78412 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX6P78412 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX6P78412 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX6P78412 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX6P78412 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX6P78412 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX6P78412 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX6P78412 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX6P78412 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX6P78412 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX6P78412 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX6P78412 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX6P78412 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX6P78412 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX6P78412 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRX6P78412 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRX6P78412 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRX6P78412 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRX6P78412 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRX6P78412 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRX6P78412 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX6P78412 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX6P78412 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX6P78412 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX6P78412 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX6P78412 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX6P78412 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX6P78412 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX6P78412 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
IRX6P78412 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
IRX6P78412 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX6P78412 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX6P78412 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX6P78412 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRX6P78412 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
IRX6P78412 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IRX6P78412 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IRX6P78412 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IRX6P78412 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IRX6P78412 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRX6P78412 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IRX6P78412 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IRX6P78412 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IRX6P78412 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
IRX6P78412 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IRX6P78412 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IRX6P78412 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IRX6P78412 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IRX6P78412 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
IRX6P78412 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IRX6P78412 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IRX6P78412 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IRX6P78412 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IRX6P78412 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX6P78412 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX6P78412 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX6P78412 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX6P78412 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX6P78412 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX6P78412 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IRX6P78412 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IRX6P78412 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IRX6P78412 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IRX6P78412 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IRX6P78412 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IRX6P78412 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms