Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ASIC1P78348 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms