Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC5P78333 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC5P78333 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC5P78333 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC5P78333 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC5P78333 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC5P78333 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC5P78333 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC5P78333 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC5P78333 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC5P78333 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC5P78333 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC5P78333 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC5P78333 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC5P78333 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC5P78333 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC5P78333 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC5P78333 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC5P78333 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC5P78333 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC5P78333 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPC5P78333 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC5P78333 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC5P78333 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPC5P78333 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC5P78333 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC5P78333 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC5P78333 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPC5P78333 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC5P78333 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC5P78333 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC5P78333 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC5P78333 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC5P78333 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC5P78333 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC5P78333 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC5P78333 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPC5P78333 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC5P78333 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC5P78333 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC5P78333 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC5P78333 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC5P78333 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC5P78333 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPC5P78333 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPC5P78333 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC5P78333 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC5P78333 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC5P78333 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC5P78333 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC5P78333 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC5P78333 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC5P78333 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC5P78333 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPC5P78333 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPC5P78333 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms