Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2P78314 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2P78314 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2P78314 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms