Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTA1P68133 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTA1P68133 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms