Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P63121 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms