Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPFP62306 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNRPFP62306 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms