Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RND3P61587 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RND3P61587 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RND3P61587 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RND3P61587 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RND3P61587 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RND3P61587 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RND3P61587 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RND3P61587 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RND3P61587 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RND3P61587 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RND3P61587 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RND3P61587 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RND3P61587 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RND3P61587 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RND3P61587 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RND3P61587 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RND3P61587 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RND3P61587 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RND3P61587 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RND3P61587 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RND3P61587 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RND3P61587 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RND3P61587 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RND3P61587 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms