Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4CP60510 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4CP60510 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PPP4CP60510 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4CP60510 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4CP60510 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4CP60510 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4CP60510 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPP4CP60510 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4CP60510 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4CP60510 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4CP60510 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4CP60510 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP4CP60510 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4CP60510 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4CP60510 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPP4CP60510 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4CP60510 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPP4CP60510 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP4CP60510 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4CP60510 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4CP60510 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4CP60510 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4CP60510 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4CP60510 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PPP4CP60510 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4CP60510 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP4CP60510 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms