Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTENP60484 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTENP60484 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTENP60484 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTENP60484 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTENP60484 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTENP60484 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTENP60484 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTENP60484 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTENP60484 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTENP60484 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTENP60484 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTENP60484 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTENP60484 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTENP60484 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTENP60484 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTENP60484 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTENP60484 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTENP60484 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTENP60484 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTENP60484 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTENP60484 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTENP60484 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTENP60484 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTENP60484 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTENP60484 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTENP60484 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTENP60484 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTENP60484 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTENP60484 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTENP60484 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTENP60484 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTENP60484 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTENP60484 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTENP60484 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTENP60484 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTENP60484 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTENP60484 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTENP60484 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTENP60484 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTENP60484 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTENP60484 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTENP60484 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTENP60484 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTENP60484 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTENP60484 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTENP60484 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTENP60484 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTENP60484 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTENP60484 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTENP60484 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTENP60484 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTENP60484 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTENP60484 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTENP60484 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTENP60484 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTENP60484 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTENP60484 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTENP60484 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms