Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS3P57727 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMPRSS3P57727 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms