Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN8P56748 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms