Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WNT3AP56704 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WNT3AP56704 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WNT3AP56704 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WNT3AP56704 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WNT3AP56704 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WNT3AP56704 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WNT3AP56704 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WNT3AP56704 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WNT3AP56704 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WNT3AP56704 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms