Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH13P55290 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH13P55290 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH13P55290 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH13P55290 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH13P55290 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH13P55290 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH13P55290 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH13P55290 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH13P55290 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH13P55290 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH13P55290 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH13P55290 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH13P55290 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH13P55290 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH13P55290 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH13P55290 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH13P55290 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH13P55290 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH13P55290 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH13P55290 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH13P55290 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH13P55290 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH13P55290 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH13P55290 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH13P55290 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH13P55290 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH13P55290 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH13P55290 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH13P55290 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH13P55290 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH13P55290 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH13P55290 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH13P55290 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH13P55290 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH13P55290 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH13P55290 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH13P55290 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH13P55290 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH13P55290 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH13P55290 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH13P55290 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH13P55290 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH13P55290 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH13P55290 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH13P55290 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH13P55290 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH13P55290 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH13P55290 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH13P55290 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH13P55290 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH13P55290 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH13P55290 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH13P55290 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms