Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POLR2KP53803 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms