Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIMK1P53667 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms