Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARFIP2P53365 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFIP2P53365 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARFIP2P53365 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms