Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA1P52294 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KPNA1P52294 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA1P52294 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms