Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP7P51809 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAMP7P51809 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms