Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA3P51805 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA3P51805 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms